Apollonia Antik Kenti, tarihi boyunca birçok medeniyete ev sahipliği yapmış önemli bir yerleşim alanıdır. MÖ 588 yılında Yunan kolonistler tarafından inşa edilen bu kent, hem Hellenistik hem de Roma dönemlerinde önemli bir kültürel ve ticari merkez haline gelmiştir. Zaman içinde çeşitli devirlerden geçen Apollonia, günümüzde arkeolojik kalıntıları ile geçmişin izlerini taşımaktadır.

Apollonia Antik Kenti'nin tarihi şu şekilde özetlenebilir:

• Kuruluş. Apollonia, MÖ 588'de Korfu ve Korint'ten gelen Yunan kolonistler tarafından, yerli İlirya kabilelerinin yaşadığı bir yerde kuruldu.
• Hellenistik dönem. Kent, bu dönemde Apollonia adını aldı ve gelişti.
• Roma dönemi. Apollonia, en parlak dönemini Roma İmparatorluğu döneminde yaşadı. Bu dönemde kent, dini ve kültürel bir merkez haline geldi.
• Gerileme. MS 3. yüzyılda, limanı hasar görmeye başlayınca kent gerilemeye başladı.
• Terk ediliş. Geç Antik Çağ'ın sonunda Apollonia terk edildi.

Apollonia Antik Kenti'nin tam olarak ne zaman kurulduğu konusunda kesin bir belge bulunmamakla birlikte, höyük buluntuları incelendiğinde kentteki ilk yerleşimin Tunç Çağı'na kadar uzandığı anlaşılmaktadır.