Akyarlar Koyu, tarihi derinlikleriyle dolu bir yerleşim alanıdır. Antik dönemlerde "Arhialla" adıyla bilinen bu koy, Karia'nın önemli limanlarından biri olarak öne çıkmıştır. Zamanla farklı kültürlerin ve medeniyetlerin etkisi altında şekillenen Akyarlar, hem Bizans hem de Osmanlı dönemlerinde önemli bir yerleşim merkezi haline gelmiştir. Günümüzde ise tarihi kalıntıları ve doğal güzellikleri ile hem yerli hem de yabancı turistlerin ilgisini çekmektedir.

Akyarlar Koyu'nun tarihi şu şekilde özetlenebilir:

• Antik Dönem: Akyarlar, antik dönemde "Arhialla" veya "Arhialla Limanı" olarak anılmıştır. Bu isim, bölgenin antik Karia coğrafyası içindeki konumuna işaret eder.
• Bizans ve Orta Çağ Dönemi: Roma İmparatorluğu'nun çöküşünden sonra bölge, Bizans egemenliğine girmiştir.
• Osmanlı Dönemi: 14. yüzyılda Mentese Beyliği'nin bölgedeki hakimiyeti, Akyarlar'ın Türk kültürüyle tanışmasını sağlamıştır.
• Cumhuriyet Dönemi: 1946 yılında, Karabağ köyüne bağlı Mandıra, Aspat, Kemer ve Kefaluka mahallelerinin birleşmesiyle Akyarlar bağımsız bir köy statüsü kazanmıştır.
• Modern Dönem: 20. yüzyılın ortalarına kadar balıkçılık ve küçük çaplı tarımla geçinen bir köy olan Akyarlar, günümüzde turizmle ön plana çıkmaktadır.

Ayrıca, Akyarlar'da dünyanın ilk eczanesinin bulunduğu ve tıbbın babası Hipokrat'ın burada faaliyet gösterdiği bilinmektedir.