Akvaryum Marmaray durağı, İstanbul'un ulaşım ağında önemli bir noktadır ve çevresinde çeşitli ulaşım alternatifleri sunmaktadır. Bu bölge, hem yerel hem de şehirlerarası yolculuklar için uygun seçenekler barındırırken, ziyaretçilerin akvaryuma ve çevresindeki diğer mekanlara kolayca ulaşmalarını sağlar. Otobüs, minibüs ve metro hatları ile desteklenen ulaşım ağı, özel araçla seyahat edenler için de avantajlar sunar.

Akvaryum Marmaray durağı çevresinde bulunan ulaşım seçenekleri şunlardır:

• Otobüs. 73B (Florya – Bakırköy), 73H (Cerrahpaşa Murat Dilmener Hastanesi – Yenibosna Metro), 73F (Florya – Taksim), 73Y (Kuyumcukent – Yeşilköy / Akvaryum), BN1 (Halkalı – Eminönü) gibi otobüs hatları Akvaryum Marmaray durağından geçmektedir.
• Minibüs. Beşyol – Florya minibüs hattı da akvaryuma ulaşımda alternatif bir seçenek sunmaktadır.
• Metro. M1A metro hattı, Florya Akvaryum Marmaray durağına oldukça yakın bir konumda yer almaktadır.
• Özel araç. E-5 Karayolu üzerinden Florya Mahallesi'ne doğru hareket ederek Marmaray durağına ulaşılabilir.

Akvaryum Marmaray durağından başka bir raylı sistem hattına doğrudan aktarma bulunmamaktadır.